《虫师第二季》故事继续讲述了青年千履谷明果为探究身为“虫师”能力的奥秘，他所遭遇和解决的种种奇异事□。在寻找真正的“龙纹石”的过程中，明果遇到了一个名叫莲华的女性。与此同时，他也逐渐认识到自己身上隐藏着更多不可思议之事。通过与各类生灵接触，并通过学习和应对各种神秘事件，明果逐渐成长并发现人性内心深处潜藏的情感和欲望。形形色色、却又扣人心弦的故事情节将牵引着观众进入这个充满幻想和启迪意义的虚拟世界中。