《美国X档案》是一部悬疑科幻片，揭开了美国政府隐藏的真∵。女特工莫尔德与男特工斯考利奇调查一系列超自然事件：被外星人控制的政要、变异生物出没的秘密实验基地，以及陷害者和陌生势力背后的阴谋。随着线索逐渐解开，他们试图阻止毁灭人类的计划并保卫正义。两位特工之间发展出深入感情，团结合作暴露隐藏在影子中的邪恶势力，并向公众揭示了真相。